Wprowadzona na rynek w roku 2008, najnowsza i obecnie produkowana, druga generacja modelu. Pierwotnie Toyota myślała o zastąpieniu Matrixa modelem Blade, mimo wszystko jednak nie doszło do tego. W zamian, samochód mocno odnowiono pod względem stylistycznym, dostało nowe, dynamiczniejsze i odrobinę większe nadwozie o charakterze sportowym. Tak jak w przypadku modelu pierwszej generacji, modelem bliźniaczym auta jest Pontiac Vibe. Obydwa samochody powstały na platformie podłogowej Toyoty o nazwie E-platform. Na rynku japońskim model sprzedawany jest jako Toyota Voltz.
