Pomimo mizernych wyników sprzedaży i wycofaniu z rynku bliźniaczego Pontiaca Vibe, model Matrix pozostał w amerykańskiej ofercie Toyoty, która w celu poprawy sprzedaży zafundowała mu kurację odmładzającą. Lifting objął modernizacje nadwozia (pojawiły się przeprojektowane zderzaki i koła) oraz przeróbki wnętrza (do kabiny trafiły zmienione zegary, poprawione fotele i ulepszone materiały wykończeniowe).