Podobnie jak pozostałe "trojaczki z Kolina" - Citroen C1 i Peugeot 107 - Toyota Aygo zapisała na kartach swojej historii dwa face-liftingi. Ten drugi, przeprowadzony w 2012 roku, przyniósł japońskiemu "maluchowi" nadwozie upiększone przeprojektowanym zderzakiem przednim i osadzone na nowych kołach, wnętrze z poprawioną deską rozdzielczą, lepszym wykończeniem i bogatszym wyposażeniem, a także silnik 1.0/68 KM/93 Nm o spalaniu obniżonym do 4,3-4,4 l/100 km.
