Szykując paletę silnikową Octavii III, Skoda postawiła na nowoczesność - w gamie pojawiły się wyłącznie turbodoładowane motory. Dla fanów jednostek benzynowych przygotowano wersje 1.2/86 KM, 1.2/105 KM, 1.4/140 KM i 1.8/180 KM, a dla wielbicieli diesli - 1.6/90 KM, 1.6/105 KM, 1.6/110 KM i 2.0/150 KM. Silniki te pojawiły się zarówno w liftbacku, jak i prezentowanym na zdjęciach rodzinnym kombi.